组织机构贯彻落实可持续发展规划的重要保证。太白山国家级自然保护区成立较早，1965年9月被陕西省人民政府批准成立，1986年7月被国务院批准为“国家级自然保护区”。1986年8月陕西太白山国家级自然保护区管理局正式成立。1995年加入了世界人与生物圈“中国生物圈保护网络”。管理机构随着时代的变化也几经更迭，并不断得到职能上的完善和管理水平上的提高。长期以来为管理维护保护区自然资源的完整性和生态系统的完整性发挥了重要作用，做出了大量工作。
    太白山自然保护区隶属省林业厅领导，属县级事业单位，编制100人。局机关设有党委办公室、行政办公室、保护科（防火办）、科研科、生态旅游科、公众教育科、计划财务科和基建办公室8个科室，同时下设蒿坪、鹦鸽、厚畛子、黄柏塬、嘴头5个保护站和铁甲树、小文公、红河谷、龙洞沟、塘口5个巡护哨卡1个中心苗圃。